Comunitar nació en 1986 por iniciativa de un grupo de mujeres y hombres ambientalistas y activistas de la educación popular con el fin de aportar a la reconstrucción de Popayán tras el terremoto de 1983, bajo una visión crítica basada en el ecodesarrollo. En 1995, reorientó sus esfuerzos hacia la participación ciudadana y la equidad social consagrada en la Constitución de 1991. 

Al evidenciar que las teorías tradicionales del ecodesarrollo eran acríticas frente a opresiones como el racismo, el androcentrismo y el antropocentrismo, e invisibilizaban las contribuciones de las mujeres, la organización transformó su enfoque. 

En 1996, cofundó la Ruta Pacífica de las Mujeres para exigir la negociación política del conflicto armado en Colombia.

Finalmente, en el año 2012, conservando su acrónimo, la organización se autoproclamó oficialmente como ecofeminista, reafirmando su decisión ética y política de aportar a la construcción de una paz justa, despatriarcalizada y descolonizada desde el sentir y pensar feminista.